尽管在生物医学领域中大量吸收了语义技术,但对于已发表的本体论中的共同建模实践知之甚少。猫头鹰本体通常仅以一组公理的粗糙形式出版,使底层设计不透明。但是,原则和系统的本体论发展生命周期可能反映在本体论的新句法结构的规律性中。为了发展对这种新兴结构的理解,我们提议反向工程学本体,采用语法指导的方法来识别和分析公理和公理集的规律性。我们根据猫头鹰公理和班级框架的句法建模趋势和常见实践来调查生物规模。我们的发现表明,生物医学本体仅共享简单的句法结构,在这些结构中,猫头鹰构造者没有以复杂的方式深入嵌套或组合。尽管这种简单的结构通常在给定的本体论中说明了大量的公理,但许多本体论还包含非平凡数量的更复杂的句法结构,这些结构在整体上并不常见。
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The goal of this paper is to detect objects by exploiting their interrelationships. Rather than relying on predefined and labeled graph structures, we infer a graph prior from object co-occurrence statistics. The key idea of our paper is to model object relations as a function of initial class predictions and co-occurrence priors to generate a graph representation of an image for improved classification and bounding box regression. We additionally learn the object-relation joint distribution via energy based modeling. Sampling from this distribution generates a refined graph representation of the image which in turn produces improved detection performance. Experiments on the Visual Genome and MS-COCO datasets demonstrate our method is detector agnostic, end-to-end trainable, and especially beneficial for rare object classes. What is more, we establish a consistent improvement over object detectors like DETR and Faster-RCNN, as well as state-of-the-art methods modeling object interrelationships.
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Plastic shopping bags that get carried away from the side of roads and tangled on cotton plants can end up at cotton gins if not removed before the harvest. Such bags may not only cause problem in the ginning process but might also get embodied in cotton fibers reducing its quality and marketable value. Therefore, it is required to detect, locate, and remove the bags before cotton is harvested. Manually detecting and locating these bags in cotton fields is labor intensive, time-consuming and a costly process. To solve these challenges, we present application of four variants of YOLOv5 (YOLOv5s, YOLOv5m, YOLOv5l and YOLOv5x) for detecting plastic shopping bags using Unmanned Aircraft Systems (UAS)-acquired RGB (Red, Green, and Blue) images. We also show fixed effect model tests of color of plastic bags as well as YOLOv5-variant on average precision (AP), mean average precision (mAP@50) and accuracy. In addition, we also demonstrate the effect of height of plastic bags on the detection accuracy. It was found that color of bags had significant effect (p < 0.001) on accuracy across all the four variants while it did not show any significant effect on the AP with YOLOv5m (p = 0.10) and YOLOv5x (p = 0.35) at 95% confidence level. Similarly, YOLOv5-variant did not show any significant effect on the AP (p = 0.11) and accuracy (p = 0.73) of white bags, but it had significant effects on the AP (p = 0.03) and accuracy (p = 0.02) of brown bags including on the mAP@50 (p = 0.01) and inference speed (p < 0.0001). Additionally, height of plastic bags had significant effect (p < 0.0001) on overall detection accuracy. The findings reported in this paper can be useful in speeding up removal of plastic bags from cotton fields before harvest and thereby reducing the amount of contaminants that end up at cotton gins.
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通用数据模型解决了标准化电子健康记录(EHR)数据的许多挑战,但无法将其集成深度表型所需的资源。开放的生物学和生物医学本体论(OBO)铸造本体论提供了可用于生物学知识的语义计算表示,并能够整合多种生物医学数据。但是,将EHR数据映射到OBO Foundry本体论需要大量的手动策展和域专业知识。我们介绍了一个框架,用于将观察性医学成果合作伙伴关系(OMOP)标准词汇介绍给OBO铸造本体。使用此框架,我们制作了92,367条条件,8,615种药物成分和10,673个测量结果的映射。域专家验证了映射准确性,并且在24家医院进行检查时,映射覆盖了99%的条件和药物成分和68%的测量结果。最后,我们证明OMOP2OBO映射可以帮助系统地识别可能受益于基因检测的未诊断罕见病患者。
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Boll Weevil(Anthonomus Grandis L.)是一种严重的害虫,主要以棉花为食。由于亚热带气候条件,在德克萨斯州的下里奥格兰德山谷等地方,棉花植物可以全年生长,因此,收获期间上一个季节的剩下的种子可以在玉米中的旋转中继续生长(Zea Mays L.)和高粱(高粱双色L.)。这些野性或志愿棉花(VC)植物到达Pinhead平方阶段(5-6叶阶段)可以充当Boll Weevil Pest的宿主。得克萨斯州的鲍尔象鼻虫根除计划(TBWEP)雇用人们在道路或田野侧面生长的风险投资和消除旋转作物的田间生长,但在田野中生长的植物仍未被发现。在本文中,我们证明了基于您的计算机视觉(CV)算法的应用,仅在三个不同的生长阶段(V3,V6)(V3,V6)中检测出在玉米场中生长的VC植物,以检测在玉米场中生长的VC植物的应用。使用无人飞机系统(UAS)遥感图像。使用Yolov5(S,M,L和X)的所有四个变体,并根据分类精度,平均平均精度(MAP)和F1得分进行比较。发现Yolov5s可以在玉米的V6阶段检测到最大分类精度为98%,地图为96.3%,而Yolov5s和Yolov5m的地图为96.3%,而Yolov5m的分类精度为85%,Yolov5m和Yolov5m的分类准确性最小,而Yolov5L的分类精度最少。在VT阶段,在尺寸416 x 416像素的图像上为86.5%。开发的CV算法有可能有效地检测和定位在玉米场中间生长的VC植物,并加快TBWEP的管理方面。
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光学成像通常用于行业和学术界的科学和技术应用。在图像传感中,通过数字化图像的计算分析来执行一个测量,例如对象的位置。新兴的图像感应范例通过设计光学组件来执行不进行成像而是编码,从而打破了数据收集和分析之间的描述。通过将图像光学地编码为适合有效分析后的压缩,低维的潜在空间,这些图像传感器可以以更少的像素和更少的光子来工作,从而可以允许更高的直通量,较低的延迟操作。光学神经网络(ONNS)提供了一个平台,用于处理模拟,光学域中的数据。然而,基于ONN的传感器仅限于线性处理,但是非线性是深度的先决条件,而多层NNS在许多任务上的表现都大大优于浅色。在这里,我们使用商业图像增强器作为平行光电子,光学到光学非线性激活函数,实现用于图像传感的多层预处理器。我们证明,非线性ONN前处理器可以达到高达800:1的压缩率,同时仍然可以在几个代表性的计算机视觉任务中高精度,包括机器视觉基准测试,流程度图像分类以及对对象中对象的识别,场景。在所有情况下,我们都会发现ONN的非线性和深度使其能够胜过纯线性ONN编码器。尽管我们的实验专门用于ONN传感器的光线图像,但替代ONN平台应促进一系列ONN传感器。这些ONN传感器可能通过在空间,时间和/或光谱尺寸中预处处理的光学信息来超越常规传感器,并可能具有相干和量子质量,所有这些都在光学域中。
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图形神经网络(GNN)正在化学工程中出现,以基于分子图的物理化学特性端到端学习。 GNNS的一个关键要素是合并函数,将原子矢量结合到分子指纹中。大多数以前的作品都使用标准池功能来预测各种属性。但是,不合适的合并功能会导致概括不佳的非物理GNN。我们根据有关学习特性的物理知识比较并选择有意义的GNN合并方法。通过量子机械计算计算出的分子特性证明了物理池函数的影响。我们还将结果与最近的SET2Set合并方法进行了比较。我们建议使用总和池来预测取决于分子大小的性能并比较分子大小无关的属性的池函数。总体而言,我们表明物理池功能的使用显着增强了概括。
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Majorana示威者是一项领先的实验,寻找具有高纯净锗探测器(HPGE)的中性s中性双β衰变。机器学习提供了一种最大化这些检测器提供的信息量的新方法,但是与传统分析相比,数据驱动的性质使其不可解释。一项可解释性研究揭示了机器的决策逻辑,使我们能够从机器中学习以反馈传统分析。在这项工作中,我们介绍了Majorana演示者数据的第一个机器学习分析。这也是对任何锗探测器实验的第一个可解释的机器学习分析。训练了两个梯度增强的决策树模型,以从数据中学习,并进行了基于游戏理论的模型可解释性研究,以了解分类功率的起源。通过从数据中学习,该分析识别重建参数之间的相关性,以进一步增强背景拒绝性能。通过从机器中学习,该分析揭示了新的背景类别对相互利用的标准Majorana分析的重要性。该模型与下一代锗探测器实验(如传说)高度兼容,因为它可以同时在大量探测器上进行训练。
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为了控制棉花场中的鲍尔象鼻虫(Anthonomus Grandis L.)害虫重新感染,目前的志愿棉花(VC)(VC)(gossypium hirsutum L.)植物检测玉米(Zea Mays L.)和Sorghum等旋转作物中的植物检测(高粱双色L.)涉及在田野边缘的手动田地侦察。这导致许多风险植物在田野中间生长仍未被发现,并继续与玉米和高粱并肩生长。当他们到达Pinhead平方阶段(5-6片叶子)时,它们可以充当鲍尔维尔虫害的宿主。因此,需要检测,定位,然后精确地用化学物质进行斑点。在本文中,我们介绍了Yolov5M在放射线和伽马校正的低分辨率(1.2兆像素)的多光谱图像中的应用,以检测和定位在康沃尔场的流苏中间(VT)生长阶段生长的VC植物。我们的结果表明,可以以平均平均精度(地图)为79%,分类精度为78%,大小为1207 x 923像素的分类精度为78%,平均推理速度在NVIDIA上的平均推理速度接近47帧(FPS) NVIDIA JETSON TX2 GPU上的Tesla P100 GPU-16GB和0.4 fps。我们还证明了基于开发的计算机视觉(CV)算法的定制无人飞机系统(UAS)的应用应用程序应用程序,以及如何将其用于近乎实时检测和缓解玉米领域中VC植物的近乎实时检测和缓解为了有效地管理鲍尔象鼻虫害虫。
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2D图像中对象检测的最受欢迎的评估度量是联合(IOU)的交集。3D对象检测的IOU指标的现有实施通常忽略一个或多个自由度。在本文中,我们首先为三维边界框提供分析解决方案。作为第二个贡献,得出了体积到体积距离的封闭形式解决方案。最后,提出边界框差为组合的正连续度量。我们将三个指标的开源实现作为独立的Python函数,以及Open3D库和ROS节点的扩展。
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